NANO组计算机集群是在科技部973课题 “基于肿瘤微环境调控的抗肿瘤纳米药物设计、合成和表征”的资助下,在高能物理研究所计算中心大力协助下,于2012搭建的。目前包含8个刀片,共396个核。其中有一个刀片留作NANO组测试用,供用户使用的刀片有7个,计348个核。
NANO组存放数据的根目录是“/nano/data”。从下图可以看到,该根目录下含有多个子目录。子目录中,除PROG,scripts和share是三个公共目录外,都是用户个人使用的目录。
下面介绍三个公共目录。
(1) 常用的应用程序安装在“PROG”;常用的数学库安装在“PROG/lib”,其中包含open mpi, Intel Fortran Library和FFTW。
(2) 常用的提交计算作业的脚本文件放在“scripts”。
(3) “share”为本组用户交换数据使用。
特别需要的软件需要用户安装在自己的目录下,这对新手linux新手来说是个巨大的挑战,此时需要咨询本组老师和其他同学。
因提交作用均须使用脚本,新用户首先需要把“/nano/data/scripts”路径放到自己的PATH环境变量中去。这些脚本文件有些是bash脚本,有些是python脚本。
为方便NANO组用户查看本组计算机使用状况,合理安排作业,“/nano/data/scripts”目录下有一个名为nanoq的脚本,在命令提示符下执行此脚本即可得到NANO集群的使用状况。下图是执行结果截图。以后一些针对NANO组用户的通告也将会在此脚本中发布。
最后祝愿所有NANO组用户在学业和工作上取得好成绩。Enjoy computation! Enjoy NANO!