高能物理研究所的标识源自著名画家吴作人先生的水墨画“无尽无极”,表现中国古代阴与阳的太极符号。阴阳太极标识寓意北京正负电子对撞机内带正电荷的正电子和带负电荷的电子高速对撞湮灭，产生τ轻子和各种粲粒子，是高能所科学研究的主要对象。阴阳的对立统一深刻体现了物质结构各个层次的规律，无尽无极。