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MOCUPY---HEPS CT重建软件-单机版V1
文章来源:   |  发布时间:2023-05-04  |  【打印】 【关闭】  |  浏览:
 

 

MOCUPY界面主要模块

   单机版CT重建软件(MOCUPY

    MOCUPYHEPS X射线显微成像线站 团队开发。         

    MOCUPY是在高能同步辐射光源(HEPS)项目支持下开发的由Python编写的基于CUDAGPU加速CT重建软件,是HEPSCT重建软件的单机版本。其主要包含图像导入、预处理、抖动校正、相位恢复以及图像重建和数据分析等模块,能够实现离线数据的快速重建。从而满足国内外同步辐射用户对于“海量”X射线CT数据处理的需求。

  软件特点

l重建核心算法100%实现GPU加速, 利用多线程实现数据的快速读取及IOCPUGPU数据处理同步进行;

l可实现多尺度CT重建转轴位置的自动校正和基于小波变换的环形伪影的去除;

l提供手动和自动两种模式的纳米CT图像的转台抖动校正算法,图像校正精度可达到亚像素;

l可实现单距离和多距离两种采集模式下的同轴相位成像的相位恢复,主要算法包括:tiectftiehom_Rytovtiehom_Paganinhioer等;测试结果显示其1022张投影数据的相位恢复仅需3分钟;

l提供FBPGridEM等多种重建算法,利用Grid网格算法能够在数秒内完成对图像尺寸为2k*2k的投影数据集的三维重建计算。

1 转台抖动校正:纳米CT图像抖动自动校正前、后的重建切片

2 相位恢复:单距离模式下骨骼样品直接重建和相位恢复后的切片

(实验数据由上海光源邓彪老师课题组提供)

  系统需求

  本软件算法使用CUDA软件库进行编写,其运行需要TuringAmpere架构核心或更新的NVIDIA显卡/计算卡(显卡的核心架构可通过: https://www.techpowerup.com/gpu-specs/?mfgr=NVIDIA&sort=name 查询)。此外,为了满足本软件较高的重建速度,请尽量使用NVMe接口固态硬盘 SSD (如:WD:SN770/SN570KBG40ZNS)进行数据的读写。

  推荐计算机显卡性能(或高于此性能)如下:   

  3 计算机参考配置


  软件更新日志

lV1.0 版本—— 2023.04.28(第一次版本升级)

【新功能】增加纳米CT转台抖动校正功能(自动、手动模式)

【新功能】增加同轴相位成像的相位恢复模块

【页面优化】重建计算时,如电脑内存不够,弹窗提示信息

lV0 版本—— 2022.09.21(初始版本)

        【系统搭建】模块功能测试并整合,实现CT重建功能


  软件开发团队

  张凯,王研,张锦,周陈鹏,袁清习

  联系方式

       张锦,zhangjin2016@ihep.ac.cn

  下载及安装

  点击下载: 软件包     |   测试数据 TestData01     |   测试数据 TestData02    

  点击在线查看: 使用手册PDF   

     测试数据说明:TestData01由黎刚老师课题组提供,可进行CT重建测试;TestData02由上海光源邓彪老师课题组提供,可进行单距离采集模式的相位CT测试。

    

 
附件下载>>>>  HEPSCT_MOCUPY操作手册-V1.0.pdf
 
扩展阅读:
·MOCUPY---HEPS CT重建软件-单机版V0
·X射线显微成像线站
 
相关链接: 中国科学院   |   中科院重大基础设施共享平台   |   北京同步辐射装置   |   上海光源   |   合肥光源   |   高能所信息监测平台-SR装置动态
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